| Goles marcados por Gaizka Mendieta en la temporada 1998-1999 |
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| Fecha | Competición | En | Rival | Goles | Árbitro | Estadio |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 20.01.1999 | Copa del Rey | Fuera | Levante UD | 1 | Iturralde González | Ciudad de Valencia |
| 18.02.1999 | Copa del Rey | Fuera | FC Barcelona | 1 | Esquinas Torres | Camp Nou |
| 24.02.1999 | Copa del Rey | Casa | FC Barcelona | 1 | López Nieto | Mestalla |
| 09.06.1999 | Copa del Rey | Casa | Real Madrid | 1 | López Nieto | Mestalla |
| 26.06.1999 | Copa del Rey | Neutral | Atlético de Madrid | 1 | Díaz Vega | La Cartuja |
| 31.10.1998 | Primera División | Fuera | Real Zaragoza | 1 | Puentes Leira | La Romareda |
| 13.03.1999 | Primera División | Fuera | Real Betis | 1 | Daudén Ibáñez | Benito Villamarín |
| 18.04.1999 | Primera División | Fuera | Real Madrid | 1 | López Nieto | Santiago Bernabéu |
| 01.05.1999 | Primera División | Casa | Deportivo Alavés | 2 | Puentes Leira | Mestalla |
| 29.05.1999 | Primera División | Casa | Real Oviedo | 1 | Megía Dávila | Mestalla |
| 20.06.1999 | Primera División | Casa | RCD Mallorca | 1 | Esquinas Torres | Mestalla |