El Valencia volvió esta temporada a la Primera División con grandes esperanzas pero prácticamente con la misma plantilla de la temporada pasada. Tal vez por esto se pasaron ciertos apuros para conservar la categoría, lo que le costó la destitución a Di Stéfano en la jornada numero 29, cubriendo la baja Roberto Gil. Se dió de baja a Cuxart, Muñoz Pérez y Sánchez Torres. En las nuevas incorporaciones destaca el éxito rotundo del fichaje de Nando procedente del Levante, lateral izquierdo de gran velocidad y garra que cuajó una brillante temporada. También engrosaron la plantilla los jugadores: Torres, David, Ciraolo del Newells Old Boys, Navajas, Rabah Madjer del Oporto, y los mestallistas Camarasa II, Granero, y Barragán. Madjer fue fichado en Enero del 88 como esperanza para mejorar la situación en la tabla clasificatoria, pero pese a venir con una gran aureola alrededor no aportó grandes cosas y pasó desapercibido con sólo 4 goles en 14 partidos. En el aspecto económico las cosas funcionaban mucho mejor. El superávit de la temporada pasada (más de 120 millones de pesetas), y el plan de saneamiento de clubes redujeron considerablemente la deuda que tenía el club. La enorme ascensión en el numero de socios (de 16 a 20 mil) daba muchas esperanzas para el futuro valencianista. Así pues se presentó un presupuesto para la presente temporada de más de ochocientos millones de pesetas, con un beneficio inicial de 133 millones. La buena gestión de Don Arturo Tuzón al frente del club empezaba a dar sus frutos. A mediados de Agosto (12, 13 y 14) se disputó el Trofeo Naranja, enfrentando al Valencia, Fiorentina y Barcelona. En el primer partido los valencianistas ganaron espectacularmente por 5-0 a los italianos con goles de Revert, Bossio, Voro, Arroyo y Fernando. El Barcelona también ganó a la Fiorentina 3-1, por lo que el trofeo de decidiría en el último partido entre el Barça y el Valencia. Con un empate, el trofeo se quedaba en casa, pero el Barcelona ganó por 1-0 gol de Lineker, Alcañiz falló un penalti ante Zubizarreta, y una vez más el trofeo se lo llevó un visitante. Si en la liga el Valencia consiguió tan solo un triste catorce puesto, en la copa tampoco tuvo mucho éxito cayendo en la tercera eliminatoria ante el Sevilla.
Campeonato Nacional de Liga
El 29 de Agosto comenzó el campeonato de liga en casa contra el Logroñes, ganando el Valencia por 2-0 con goles de Voro y Arroyo. Con el buen juego demostrado en el Naranja y esta victoria se abrían muchas esperanzas para la presente competición de liga, y no se conoció la derrota hasta la sexta jornada con cuatro victorias y un empate, nueve goles a favor y tres en contra, estando clasificado en segunda posición en la jornada quinta. Al finalizar el año estábamos ya en la posición numero 13 llegando a bajar hasta la posición quince. Es muy dificil poder explicar este espectacular bajón. Desde la jornada 12 hasta la 17 el equipo solo consiguió 1 punto de doce posibles con cuatro derrotas consecutivas frente al Español, Cádiz, Athletic de Bilbao, y Atlético de Madrid. La situación ya era muy crítica con el equipo en el puesto 14. Quique se lesionó contra el Celta en la jornada 21. Rotura ligamento cruzado de la rodilla, y al quirófano. Madjer se rompió tres jornadas más tarde, llegando a estar la enfermería del Valencia, un encuentro después con Arias, Quique, Fernando, Bossio, y Madjer. Y con la enfermería repleta debutó Paco Camarasa, aunque solo jugó cinco minutos contra la Real Sociedad en el Luis Casanova. Fue en la jornada 25 y no volvió a jugar hasta la siguiente temporada. Y llegó la jornada 29 donde el Valencia perdió en casa frente al Zaragoza y Alfredo Di Stéfano fue sustituido por Roberto Gil. El siguiente partido se empató en Pamplona frente al Osasuna y una jornada después se ganó, por fin, en casa frente a Las Palmas por 3-1 (Voro, Alcañiz, Jon García), después de nueve jornadas sin conocer la victoria. El Valencia acabo esta temporada en el puesto 14, marcando 44 goles, y los goleadores en esta temporada fueron: Fernando (10 goles), Alcañiz (7 goles), Giner, Subirats, Fenol, Madjer (4 goles), Arroyo (3 goles), Voro y Jon García (2 goles), Quique, Nando, Juárez y Montes (1 gol). En la competición liguera, ésta fue la clasificación final:
Otro tropiezo más en Copa. De nuevo el equipo volvía a pasar eliminatorias ante rivales asequibles y caía derrotado ante un primera. Contra el Maspalomas, primer rival en Copa en la primera ronda, el Valencia ganó los dos partidos que disputó, aunque sin tener una actuación brillante, con un computo total a favor de los valencianistas de 3-0. El primer partido se disputó el 27 de Octubre de 1987 y el Valencia ganó como visitante con un marcador de 0-1, gracias al gol de Alcañiz. En el Luis Casanova, el Valencia volvió a ganar, esta vez con un 2-0. Fue el 22 de Octubre y consiguieron marcar para el conjunto "che", Fernando y Alcañiz. El siguiente adversario en la segunda eliminatoria fue el Salamanca. El Valencia se impuso 0-2 en el partido de ida con goles de Giner, y de nuevo Alcañiz, que había conseguido anotar en todos los partidos de copa disputados hasta el momento. En el Luis Casanova, el Valencia no consiguió más que un empate a un tanto, marcador que daba la eliminatoria al equipo del Turia, en un partido pasado por agua y con un terreno de juego muy pesado. Fenoll anotó para el Valencia CF Los partidos se disputaron el 27 de Octubre y el 3 de Noviembre, respectivamente. Y cuando llegó un primera, se fue el Valencia. El verdugo sería esta vez en la tercera ronda el Sevilla CF. El 11 de Noviembre se disputó en Valencia el partido de ida, en un encuentro sin goles. Nervios para el partido de vuelta que se tenía que jugar el 2 de Diciembre en la ciudad de Sevilla. Y de los nervios al nuevo fracaso. En el Sánchez Pizjuán, el Sevilla se impuso con un duro 3-0, marcador que volvía a apear al Valencia de una competición, en la que hacía ocho años que no levantaba cabeza. Demasiado tiempo para un histórico del fútbol español.