Juan José Urruti nació en Rosario, Santa Fe, y comenzó su carrera deportiva en 1979 jugando como extremo izquierdo para Racing de Córdoba. Allí permanece hasta 1983, cuando a los 21 años, el Valencia CF lo contrata como único fichaje de renombre para completar una plantilla que, debido a la crisis económica, había perdido mucho nivel. Se le recibió con entusiasmo, ya que la afición estaba necesitada de alegrías, y el argentino recodaba a Valdez, por la posición y por el estilo de juego.

Urruti era un zurdo rápido y hábil, con un arranque y aceleración que le permitían desbordar a los rivales sin aparente esfuerzo. Pese a ello, en Mestalla no pudo demostrar todas estas cualidades, entre otras cosas porque el equipo se encontraba en uno de los peores momentos de su historia, y tocaba más arremangarse y ponerse el traje de faena que deslumbrar a la grada con filigranas. Después de tres temporadas, había disputado 61 partidos y había hecho cuatro goles, por lo que salía a un gol cada 15 partidos, por lo que su productividad no ayudó al Valencia a salir de los infiernos. En julio de 1986, tras el dramático descenso a Segunda División, volvió a su tierra para jugar con Rosario Central.

Se mantuvo ligado al equipo argentino hasta 1988, y consiguió proclamarse campeón en 1987. Finalizado su contrato se trasladó a Bolivia para formar parte del plantel de Bolívar, donde jugó hasta 1990. En 1991 regresó a Argentina, en donde probó suerte en Platense. Ese año regresó a Bolivia para formar parte nuevamente de las filas del Bolívar, donde permaneció hasta 1992. En 1993 formó parte de las filas de Jorge Wilstermann, hasta el año 1995. En 1996 ficha por el CD San José, también de Bolivia. En 1997 se fue a Chile, en donde terminó su carrera como futbolista profesional en el Huachipato.