| Goles marcados por Juan Sánchez en la temporada 1999-2000 |
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| Fecha | Competición | En | Rival | Goles | Árbitro | Estadio |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 15.08.1999 | Supercopa de España | Fuera | FC Barcelona | 1 | López Nieto | Camp Nou |
| 25.08.1999 | Champions League | Casa | Hapoel Haifa | 2 | Anders Frisk | Mestalla |
| 15.03.2000 | Champions League | Fuera | Girondins de Burdeos | 1 | Fritz Stuchlik | Chaban Delmas |
| 29.08.1999 | Primera División | Fuera | RCD Espanyol | 1 | Carmona Méndez | Montjuic |
| 04.12.1999 | Primera División | Casa | Sevilla FC | 1 | Turienzo Álvarez | Mestalla |
| 12.12.1999 | Primera División | Fuera | Atlético de Madrid | 1 | Japón Sevilla | Vicente Calderón |
| 19.12.1999 | Primera División | Casa | Rayo Vallecano | 2 | Puentes Leira | Mestalla |
| 23.07.1999 | Pretemporada | Fuera | FC Kleve | 1 | Kieffen | Volksbank-Arena |
| 06.10.1999 | Copa Generalitat | Neutral | Villarreal CF | 2 | Fernández Marín | Foietes |
| 16.11.1999 | Trofeo Naranja | Casa | FC Salzburg | 1 | Fernández Marín | Mestalla |