Emilio Ibáñez empezó su carrera futbolística en las categorías inferiores del Foios, fichando por la escuela del Valencia en 1990, donde permaneció 4 años pasando por el equipo cadete, el juvenil C, juvenil B y juvenil A sub-19, antes de llegar al Mestalla, filial del Valencia. Debutó en Segunda División B de la mano de Pep Balaguer el 4 de septiembre de 1994, en la primera jornada de Liga contra el Castellón. Aquel primer año, Emilio jugó 6 partidos en los que anotó un gol. Ese mismo año, finalizando la temporada, debutó con el primer equipo en un partido amistoso contra el Celta disputado en Mestalla, y posteriormente participó en varios partidos de la Liga Autonómica. Desgraciadamente, pocos meses después de su debut cayó lesionado gravemente con una fractura de tibia y peroné, cortándose su progresión.

Una vez recuperado de su grave lesión, el futbolista volvió a jugar en el Mestalla, donde se mantuvo durante 3 temporadas, desde 1995 hasta 1998, participando en 28 partidos en los que marcó 3 goles, pero sin tener más opciones con el primer equipo. Al salir el año siguiente del Valencia, fichó por el Ontinyent, con el que jugó 25 partidos y marcó 2 goles en la Segunda División B. La temporada siguiente volvió al Foios de su pueblo natal, donde acabó su carrera deportiva joven, con 30 años.