José María Cases se formó en la cantera del Villarreal, donde llegó a debutar con el primer equipo en Primera División, allí permaneció hasta 2005, cuando fue fichado por el Terrassa, donde estuvo un año, después fichó por el Orihuela CF donde permaneció dos temporadas, en la 2008-2009 jugó en Segunda División con la SD Eibar, y en la temporada 2009-2010 jugó en el Mestalla, filial del Valencia, donde permaneció una única temporada, llegando a debutar con el primer equipo en dos paratidos amistosos, contra el Ribarroja y contra el Acero.

Después regresó al Orihuela donde estuvo desde 2010 hasta invierno de 2012, cuando fue fichado por el Granada, que lo cedió hasta final de temporada al Cádiz. En la temporada 2012-2013, el Granada lo volvió a ceder esta vez al Mirandés. En el mercado de invierno de la temporada 2012-2013, el jugador abandona el equipo burgalés y firma en calidad de cedido hasta el final de temporada por el Alcoyano. En junio de 2013, rescinde su contrato con el Granada para fichar por el Panthrakikos de la Superliga Griega. En 2015 ficha por el KAS Eupen de la liga belga, y en el verano de 2017 marcha de nuevo a Grecia para jugar con el Doxa Drama. En el verano de 2018 regresó a España para defender de nuevo los colores del Orihuela.