Defensa derecho, Rafael Civera ingresó en el Gimnástico en 1921 procedente del Patronato de la Juventud Obrera. Se mantuvo en el equipo hasta su fichaje por el Valencia CF en 1928. No llegó a consolidarse en la primera plantilla, por lo que alternó convocatorias con el primer equipo y el equipo reserva. Debutó en el Regional en noviembre de ese mismo año y en Segunda División el 23 de junio de 1929, en la jornada 27. Fue titular en dos partidos de la categoría de plata, y en varios amistosos hasta su regreso al Gimnástico tras la pretemporada de 1932.